本题考查车船税。
【选项B正确】对节能汽车，减半征收车船税（自2018年7月10日起执行）。
【选项C正确】三轮汽车属于商用货车，征收车船税。
【选项A、D、E错误】捕捞、养殖渔船，警用车船和新能源车船均免征增值税。
因此，本题正确答案为选项BC。
本题考查教育、科学技术和医疗卫生支出。
近年来，我国政府高度重视加大教育经费投入问题，教育经费来源构成的基本特征仍是以政府投入为主，但目前已经逐渐形成政府投入、民间投资、社会捐赠、事业收费（含学杂费）及其他经费等多种形式、多元化的教育资金来源结构。
因此，本题正确答案为选项D。
本题考查政府预算模式。
国有资本经营预算的分配主体是作为生产资料所有者代表的政府；它以国有资产的宏观经营并取得宏观经济效益为分配目的，以资产所有权为分配依据；其收支内容基本上是围绕着对经营性国有资产进行价值管理和分配形成的，因而国有资本经营预算属于经营型预算。
因此，本题正确答案为选项B。
本题考查增值税应纳税额的计算。
水路运输的程租、期租业务，属于交通运输服务中的水路运输服务，税率为9%；打捞属于现代服务，税率为6%。
依据题干数据，该公司6月应缴纳的增值税=1 090÷（1+9%）×9%+272.5÷（1+9%）×9%+173.31÷（1+6%）×6%-39=83.31（万元）。
因此，本题正确答案为选项A。
本题考查分税制财政管理体制的基本问题。
“分事”，是按照一定社会管理和经济体制的要求，在各级政府间划分社会管理权和经济管理权，并以此为依据确定各级政府的预算支出范围。
因此，本题正确答案为选项A。
本题考查印花税。
【选项D正确】发电厂与电网之间、电网与电网之间书立的购售电合同，应当按买卖合同税目缴纳印花税。
【选项E正确】企业之间书立的确定买卖关系、明确买卖双方权利义务的订单、要货单等单据，且未另外书立买卖合同的，应当按规定缴纳印花税。
【选项A、B、C错误】下列情形的凭证，不属于印花税征收范围：
（1）人民法院的生效法律文书，仲裁机构的仲裁文书，监察机关的监察文书。
（2）县级以上人民政府及其所属部门按照行政管理权限征收、收回或者补偿安置房地产书立的合同、协议或者行政类文书。
（3）总公司与分公司、分公司与分公司之间书立的作为执行计划使用的凭证。
因此，本题正确答案为选项DE。
