本题考查增值税应纳税额的计算。

按照规定不得抵扣进项税额的不动产，发生用途改变，用于允许抵扣进项税额项目的，按照下列公式在改变用途的次月计算可抵扣进项税额：可抵扣进项税额=增值税扣税凭证注明或计算的进项税额×不动产净值率。

依据题干数据，可抵扣进项税额=100×90%=90（万元）。

因此，本题正确答案为选项A。

本题考查企业所得税的税率。

【选项D错误】至2030年12月31日，对设在西部地区的鼓励类产业企业减按15%的税率征收企业所得税。鼓励类产业企业是指以《西部地区鼓励类产业目录》中规定的产业项目为主营业务，且其主营业务收入占企业收入总额60%以上的企业。

因此，本题正确答案为选项D。

本题考查个人所得税的税收优惠。

【选项D错误】个人转让自用5年以上且是唯一家庭生活用房取得的收入，免征个人所得税。

因此，本题正确答案为选项ABCE。

本题考查增值税应纳税额的计算。

增值税的计税依据即为销售额，销售额为纳税人发生应税销售行为取得的全部价款和价外费用，但是不包括收取的销项税额。包装物租金属于价外费用。

依据题干数据，甲公司当月该笔业务的增值税销项税额=（113 000+6 780）÷（1+13%）×13%=13 780（元）。

因此，本题正确答案为选项B。