本题考查土地增值税。
该公司转让房产中获得的增值额=12 000-7 000=5 000（万元）。
增值率=5 000÷7 000≈71.43%
根据土地增值税四级超率累进税率（见下表），确定税率为40%，速算扣除系数为5%。
则应纳土地增值税税额=5 000×40%-7 000×5%=1 650（万元）。
因此，本题正确答案为选项D。
本题考查耕地占用税。
农村居民在规定用地标准以内占用耕地新建自用住宅，按照当地适用税额减半征收耕地占用税。 耕地占用税应纳税额的计算公式为：应纳税额=实际占用的耕地面积（平方米）×适用定额税率。
依据题干数据，该农民应纳耕地占用税=200×7×50%=700（元）。
因此，本题正确答案为选项B。
本题考查契税。
【选项D错误】自2016年2月22日起，对个人购买家庭唯一住房（家庭成员范围包括购房人、配偶以及未成年子女），面积为90平方米及以下的，减按1%的税率征收契税，面积为90平方米以上的，减按1.5%的税率征收契税。
【选项E错误】个人首次购买90平方米以下改造安置住房，按1%的税率计征契税；购买超过90平方米，但符合普通住房标准的改造安置住房，按法定税率减半计征契税。
因此，本题正确答案为选项ABC。
本题考查耕地占用税。
【选项D错误】纳税人应当自纳税义务发生之日起30日内申报缴纳耕地占用税。
因此，本题正确答案为选项D。
本题考查土地增值税。
【选项D错误】土地增值税对以继承、赠与等方式无偿转让的房地产，不予征税。
【选项E错误】如果投资联营的企业从事房地产开发，或者房地产开发企业以其建造的商品房进行投资联营的不能免征土地增值税。
因此，本题正确答案为选项ABC。
本题考查土地增值税。
【选项A错误】纳税人建造普通标准住宅出售，增值额未超过扣除项目金额20%的，免征土地增值税；增值额超过扣除项目金额之和20%的，应就其全部增值额按规定计税。普通标准住宅是指按所在地一般民用住宅标准建造的居住用住宅。高级公寓、别墅、度假村等不属于普通标准住宅。普通标准住宅与其他住宅的具体划分界限由各省、自治区、直辖市人民政府规定。
【选项C错误】企业按照公司法有关规定整体改制，包括非公司制企业改制为有限责任公司或股份有限公司，有限责任公司变更为股份有限公司，股份有限公司变更为有限责任公司，对改制前的企业将国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物（以下称房地产）转移、变更到改制后的企业，暂不征收土地增值税。
因此，本题正确答案为选项BDE。
