本题考查耕地占用税。
我国主要的耕地占用税税收优惠措施包括：
①占用耕地建设农田水利设施的，不缴纳耕地占用税。
②军事设施、学校、幼儿园、社会福利机构、医疗机构占用耕地，免征耕地占用税；【选项A、B、C、D】
③铁路线路、公路线路、飞机场跑道、停机坪、港口、航道、水利工程占用耕地，减按每平方米2元的税额征收耕地占用税。
④农村居民在规定用地标准以内占用耕地新建自用住宅，按照当地适用税额减半征收耕地占用税；其中农村居民经批准搬迁，新建自用住宅占用耕地不超过原宅基地面积的部分， 免征耕地占用税。
⑤农村烈士遗属、因公牺牲军人遗属、残疾军人以及符合农村最低生活保障条件的农村居民，在规定用地标准以内新建自用住宅，免征耕地占用税。
⑥纳税人因建设项目施工或者地质勘查临时占用耕地，应当依照规定缴纳耕地占用税。
因此，本题正确答案为选项ABCD。
本题考查契税。
【选项A错误】以自有房屋作股权投入本人独资经营企业，免纳契税。
【选项B错误】经房屋所有人同意，使用者可以通过变更租赁合同，办理过户手续，互换房屋使用权。所互换房屋的价值相等的不征收契税。
【选项C正确】买房拆料或翻建新房，应照章征收契税。
【选项D错误】房屋所有权相互交换，双方交换价值相等，免征契税，办理免征契税手续。
因此，本题正确答案为选项C。
本题考查土地增值税。
【选项B错误】纳税人建造普通标准住宅出售，增值额未超过扣除项目金额之和20%的，免征土地增值税；增值额超过扣除项目金额之和20%的，应就其全部增值额按规定计税。
因此，本题正确答案为选项B。
本题考查土地增值税。
该公司转让房产中获得的增值额=12 000-7 000=5 000（万元）。
增值率=5 000÷7 000≈71.43%
根据土地增值税四级超率累进税率（见下表），确定税率为40%，速算扣除系数为5%。
级数 | 增值额与扣除项目金额的比率 | 税率（%） | 速算扣除系数（%） |
1 | 未超过50%部分 | 30 | 0 |
2 | 超过50%、未超过100%的部分 | 40 | 5 |
3 | 超过100%、未超过200%的部分 | 50 | 15 |
4 | 超过200%的部分 | 60 | 35 |
则应纳土地增值税税额=5 000×40%-7 000×5%=1 650（万元）。
因此，本题正确答案为选项D。
本题考查土地增值税。
【选项A错误】纳税人建造普通标准住宅出售，增值额未超过扣除项目金额20%的，免征土地增值税；增值额超过扣除项目金额之和20%的，应就其全部增值额按规定计税。普通标准住宅是指按所在地一般民用住宅标准建造的居住用住宅。高级公寓、别墅、度假村等不属于普通标准住宅。普通标准住宅与其他住宅的具体划分界限由各省、自治区、直辖市人民政府规定。
【选项C错误】企业按照公司法有关规定整体改制，包括非公司制企业改制为有限责任公司或股份有限公司，有限责任公司变更为股份有限公司，股份有限公司变更为有限责任公司，对改制前的企业将国有土地使用权、地上的建筑物及其附着物（以下称房地产）转移、变更到改制后的企业，暂不征收土地增值税。
因此，本题正确答案为选项BDE。
本题考查土地增值税。
①土地增值税应税收入=10 000（万元）。
②取得土地使用权所支付的金额=1 000（万元）；
房地产开发成本=3 000（万元）；
财务费用中的利息支出，凡能够按转让房地产项目计算分摊并提供金融机构证明的，允许据实扣除，但最高不能超过按商业银行同类同期贷款利率计算的金额。其他房地产开发费用，在按照“取得土地使用权所支付的金额”与“房地产开发成本”金额之和的5%以内计算扣除。所以，房地产开发费用=500+（1 000+3 000）×5%=700（万元）；
与转让房地产有关的税金=555（万元）；
对从事房地产开发的纳税人可按“取得土地使用权所支付的金额”与“房地产开发成本”规定计算的金额之和，加计20%的扣除。所以，财政部规定的其他扣除项目=（1 000+3 000）×20%=800（万元）
扣除项目金额=1000+3000+700+555+800=6055（万元）
③该公司转让房产中获得的增值额=10000-6055=3945（万元）
④增值率=3945÷6055×100%=65.15%。
⑤
级数 | 增值额与扣除项目金额的比率 | 税率（%） | 速算扣除系数（%） |
1 | 未超过50%部分 | 30 | 0 |
2 | 超过50%、未超过100%的部分 | 40 | 5 |
3 | 超过100%、未超过200%的部分 | 50 | 15 |
4 | 超过200%的部分 | 60 | 35 |
确定土地增值税税率为40%，速算扣除系数为5%，应纳土地增值税税额=3945×40%-6055×5%=1275.25（万元）。
因此，本题正确答案为选项A。
