甲公司在安装过程中需要在A软件现有基础上对其进行定制化的重大修改，以使其能够与客户现有的信息系统相兼容，说明销售A软件与其定制安装服务在合同层面不可明确区分，应将销售A软件与定制安装服务一起确认为单项履约义务，选项C正确，当选；选项A、B错误，不当选。

提供未来3年的软件更新服务，与销售A软件及安装可单独区分，构成单项履约义务，选项D错误，不当选。

【知识链接】

下列情形因通常表明企业向客户转让商品的承诺与合同中其他承诺不可单独区分，而不构成单项履约义务： 

（1）企业需提供重大的服务以将该商品与合同中承诺的其他商品整合成合同约定的组合产出转让给客户。 

（2）该商品将对合同中承诺的其他商品予以重大修改或定制。 

（3）该商品与合同中承诺的其他商品具有高度关联性。

企业向客户承诺的商品同时满足下列两个条件的，应当作为可明确区分商品：

（1）客户能够从该商品本身或从该商品与其他易于获得的资源一起使用中受益；

（2）企业向客户转让该商品的承诺与合同中其他承诺可单独区分。

下列情形通常表明，企业向客户转让该商品的承诺与合同中的其他承诺不可明确区分：

（1）企业需提供重大的服务以将该商品与合同中承诺的其他商品进行整合，形成合同约定的某个或某些组合产出转让给客户；

（2）该商品将对合同中承诺的其他商品予以重大修改或定制；

（3）该商品与合同中承诺的其他商品具有高度关联性。

企业在估计商品的单独售价时，可使用的方法有市场调整法、成本加成法、余值法等方法，选项ABC正确。期望值法属于估计可变对价的最佳估计数的方法，选项D错误。